人文社会系研究科：基础文化研究、日本文化研究、亚洲文化研究、欧美文化研究、社会文化研究、文化资源学研究、韩国朝鲜文化研究

　　教育学研究科：综合教育科学、学校教育高度化、

　　法学政治学研究科：综合法政、法曹培养

　　经济学研究科：经济理论、现代经济、企业市场、经济史、金融系统

　　综合文化研究科：语言信息科学、超领域文化科学、地域文化研究、国际社会科学、广域科学

　　理学系研究科：物理学、天文学、地球行星科学、化学、生物化学、生物科学

　　工学系研究科：社会基础学、建筑学、都市工学、机械工学、、环境海洋工学、材料工学、应用化学等

　　农学生命科学研究科：生产环境生物学、应用生命化学、应用生命工学、森林科学、水圈生物科学等

　　医学系研究科：分子细胞生物学、机能生物学、病因病理学、生体物理医学、脑神经医学、社会医学

　　药学系研究科：分子药学、机能药学、生命药学

　　数理科学研究科：数理科学

　　学际信息学府：学际信息学